單基因遺傳病是指由單個基因變異引發(fā)的遺傳性疾病,雖然單一病種的發(fā)病率低,但由于種類繁多,綜合發(fā)病率累計高達(dá)1/100,已超過唐氏綜合征。而臨床常規(guī)開展的各類孕產(chǎn)檢都無法對單基因遺傳病進(jìn)行有效篩查,目前單基因遺傳病已成為導(dǎo)致出生缺陷的一大主要元兇。研究表明,平均每個正常人攜帶2.8個致病突變,目前我國每年新增出生缺陷90萬例患兒中,地中海貧血患兒約占3.5萬例(含中間型、重型及Bart's水腫胎),先天性聽力障礙患兒約3.2萬例。多數(shù)單基因遺傳病致殘致死性高,嚴(yán)重影響家庭幸福和社會發(fā)展。
國務(wù)院發(fā)布的《健康中國行動(2019年-2030年)》也明確將“主動學(xué)習(xí)掌握出生缺陷防治知識”作為適用于個人和社會的倡導(dǎo)性指標(biāo)納入評估體系,開展攜帶者篩查是預(yù)防出生缺陷最有效的措施。
自從我司天昊檢驗(yàn)的貝康諾®單基因遺傳病攜帶者篩查推出市場以來,在出生缺陷單基因遺傳病防控方面取得了亮眼的成績。為提高出生缺陷防治率,擴(kuò)大攜帶者篩查的普及率,天昊檢驗(yàn)憑借行業(yè)內(nèi)的十?dāng)?shù)載深耕,在原有貝康諾®22種遺傳病攜帶者篩查的基礎(chǔ)上針對風(fēng)險更高、發(fā)病率更高的6種單基因遺傳病提供了更加經(jīng)濟(jì)普適的小Panel攜帶者篩查,讓更多家庭進(jìn)行快速、準(zhǔn)確地攜帶者篩查成為可能。
天昊針對我國人群攜帶率最高的遺傳性耳聾(我國每1000個新生兒中就有2~3名遺傳性耳聾患兒,正常人群中約4-5%的人至少攜帶一種耳聾基因),和以甘肅、寧夏為首的西北地區(qū)發(fā)病率較高而被列為中國新生兒需要篩查的遺傳代謝類疾病之一的苯丙酮尿癥(甘肅、寧夏地區(qū)發(fā)病率1/3030-1/3420【1.2】);以及我國南方地區(qū)高發(fā)的地中海貧血;再加上含有特殊突變類型一般檢測方法無法很好進(jìn)行篩查的,但又是國人高發(fā)并且無有效治療手段的脊髓性肌肉萎縮癥(SMA)、假肥大性肌營養(yǎng)不良(DMD)和脆性X綜合征(FXS)這6種常見遺傳病,推出了適合全國進(jìn)行普篩的全新的貝康諾®六種遺傳病基因突變攜帶者篩查,這是天昊在遺傳病攜帶者篩查領(lǐng)域的又一重磅新品!
該產(chǎn)品采用我司自主研發(fā)系列專利或特有技術(shù)(SNPscan®、CNVplex®、特殊熒光 PCR)對6種常見的重大遺傳病疾病致病性明確的254種已知突變位點(diǎn)進(jìn)行檢測,適用于所有處于備孕、孕早中期欲實(shí)現(xiàn)優(yōu)生優(yōu)育的人群(<20周)。
???產(chǎn)品設(shè)計
我司早期與南京市婦幼保健院遺傳醫(yī)學(xué)中心的許爭峰教授團(tuán)隊(duì)合作的科研課題發(fā)文中已表明天昊的基于CE平臺擴(kuò)展性攜帶者篩查產(chǎn)品臨床可行性好、檢測效果優(yōu)、預(yù)防出生缺陷率高。與NGS平臺相比,天昊遺傳病基因突變攜帶者篩查操作更簡單,其敏感性、特異性、準(zhǔn)確性分別高達(dá)97.4%,100%,99.6%,并且具有易于解讀、便于檢測后的遺傳咨詢、成本低、可檢測部分二代測序無法檢測的特殊基因突變等優(yōu)點(diǎn)。通過貝康諾®15種遺傳病基因突變攜帶者篩查,在1915對無家族遺傳病史,無不良孕產(chǎn)史的健康夫婦中,篩出高危夫婦共30對,即高危夫婦比例為1.57%。因此,理論發(fā)病率為3.2‰,遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于唐氏綜合征的發(fā)病率(1/700-1/1000),體現(xiàn)了在我國開展擴(kuò)展性攜帶者篩查的必要性【3】。
按之前遺傳病篩查的有效性來推算,6種遺傳病攜帶者篩查的高危夫婦比例約為0.73%(若在我國南方地區(qū)進(jìn)行普篩,由于地貧的高攜帶率,預(yù)計高風(fēng)險夫婦篩出比例~1%)。
???產(chǎn)品優(yōu)勢
①經(jīng)濟(jì)高效:
針對國人高發(fā)并且嚴(yán)重致病的6種遺傳病進(jìn)行篩查,價格便宜,適合大規(guī)模人群的普篩,性價比極高。
②領(lǐng)先的自主專利技術(shù):
利用自主專利技術(shù),除可進(jìn)行常規(guī)點(diǎn)突變檢測外,還可對NGS技術(shù)無法精準(zhǔn)檢測的小片段拷貝數(shù)變異及FMR1的CGG重復(fù)數(shù)進(jìn)行精準(zhǔn)檢測。
③突變覆蓋全:
可對α-地貧的HS-40調(diào)控區(qū)域以及anti3.7,anti4.2,香港型地貧等重組類型進(jìn)行檢測以及最高可檢測8拷貝的HBA綜合拷貝數(shù)。另外還增加了脊髓性肌肉萎縮癥點(diǎn)突變等區(qū)別于常規(guī)攜篩產(chǎn)品,以此來降低攜篩的漏檢及錯檢率。
④檢測結(jié)果有保障:
在檢測過程中引入公司專利保護(hù)的分子內(nèi)標(biāo)質(zhì)控體系,可有效避免多步驟操作造成結(jié)果混淆的風(fēng)險。
???產(chǎn)品對比
天昊檢驗(yàn)的新產(chǎn)品——貝康諾®六種遺傳病基因突變攜帶者篩查,相比于傳統(tǒng)的單項(xiàng)遺傳病篩查以及NGS版拓展型攜帶者篩查,具有獨(dú)特的優(yōu)勢及特點(diǎn)。它采用了先進(jìn)的專利技術(shù)和創(chuàng)新的設(shè)計,功能強(qiáng)大,能為用戶提供更好的體驗(yàn)和效果。
???檢測原理
采用連接酶高特異性連接反應(yīng)對目的區(qū)域進(jìn)行雜交、連接,通過專利技術(shù)在連接探針末段引入不同長度的標(biāo)簽序列獲得長度各異的目的探針連接產(chǎn)物,利用熒光標(biāo)記的通用引物對連接產(chǎn)物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,通過熒光毛細(xì)管電泳對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行電泳分離檢測,最后通過對電泳圖譜的分析獲取各個位點(diǎn)的峰高,進(jìn)而對樣品目的區(qū)域的拷貝數(shù)進(jìn)行分析確定。
本方法適用于各個涉及到目標(biāo)基因片段拷貝數(shù)變異檢測的遺傳學(xué)研究領(lǐng)域或臨床檢測項(xiàng)目,具有以下優(yōu)勢:
◆通量高:1根毛細(xì)管同時實(shí)現(xiàn)48-400個基因區(qū)段拷貝數(shù)快速檢測,檢測效率高。
◆分辨率高:可對6拷貝以內(nèi)的片段進(jìn)行準(zhǔn)確定量。
◆準(zhǔn)確性高:基于高特異性的連接原理,檢測區(qū)域連接產(chǎn)物采用通用引物擴(kuò)增,擴(kuò)增效率基本一致,平均檢測CV<10%。
利用連接反應(yīng)的高特異性實(shí)現(xiàn)對SNP位點(diǎn)等位基因的識別,在連接探針末段引入不同長度的非特異序列,獲得位點(diǎn)對應(yīng)的不同長度連接產(chǎn)物,利用標(biāo)記熒光的通用引物對連接產(chǎn)物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,通過多重?zé)晒馄畏治鰧U(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行分離,最后通過GeneMapper軟件分析獲取各個SNP位點(diǎn)的基因型。
本技術(shù)應(yīng)用于需要SNP分型的遺傳學(xué)領(lǐng)域,檢測通量高,能在一個檢測體系中同時實(shí)現(xiàn)對48/96/144/192 個SNP位點(diǎn)進(jìn)行分型,其檢測準(zhǔn)確率可達(dá)99.9%;每個位點(diǎn)的平均樣本檢出率可達(dá)98%以上。
???檢測流程
???檢測效果圖
體系原始數(shù)據(jù)圖
正常女性FMR1基因
全突變女性攜帶者FMR1基因
DMD檢測效果圖
???檢測意義
優(yōu)生優(yōu)育是我國提升國民健康素質(zhì)的重要政策,重大遺傳病患兒的出生直接給家庭和社會帶來沉重經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)和精神負(fù)擔(dān)。通過6項(xiàng)攜帶者篩查進(jìn)行一級和二級預(yù)防,能夠有效避免遺傳性耳聾、地中海貧血、苯丙酮尿癥、脊髓性肌萎縮癥、假肥大性肌營養(yǎng)不良和脆性X綜合征患兒的出生,既能明顯降低單基因遺傳病患兒的出生率,響應(yīng)國家優(yōu)生優(yōu)育的號召,又可為百姓減輕生育健康寶寶基因檢測的費(fèi)用,最大程度降低撫育患兒的負(fù)擔(dān)。對提升家庭的幸福程度,維護(hù)家庭的穩(wěn)定、社會的穩(wěn)定都起到了積極的作用。
說明:SLC26A4其它大片段缺失重復(fù)突變僅檢測覆蓋外顯子1-3,5-6,7或18的其它缺失重復(fù)突變;PAH其它大片段缺失重復(fù)突變僅針對涉及外顯子1,5或6的缺失重復(fù)突變,覆蓋至少報道2次以上的CNV突變;SMN大片段缺失重復(fù)突變僅檢測覆蓋至少2個鄰近外顯子或單個7號外顯子的缺失重復(fù)突變;DMD大片段缺失重復(fù)突變覆蓋以下外顯子的缺失重復(fù)突變(1,2,3,5,6,7,8,10,12,13,17,19,22,24,30,43,44,45,46,47,48,50,51,52,53,54,55,56,61,62,63,65,70)。
蘇州天昊醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所是一家提供生殖健康、單基因遺傳病、腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)、病原微生物以及藥物基因組學(xué)等領(lǐng)域內(nèi)臨床診斷及臨床研究相關(guān)基因檢測服務(wù)的第三方醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)機(jī)構(gòu)。主要應(yīng)用于5大分子遺傳檢測方向:重大遺傳病篩查與診斷、新生兒重大出生缺陷篩查、產(chǎn)前篩查與診斷、個體化治療、癌癥風(fēng)險及預(yù)后檢測等。
目前,主要代表產(chǎn)品有染色體非整倍體基因檢測、染色體微缺失微重復(fù)突變檢測、貝康諾®六種遺傳病基因突變攜帶者篩查、貝康諾®三種遺傳?。⊿MA/DMD/FXS)基因突變攜帶者篩查、貝康諾®二十二種遺傳病基因突變攜帶者篩查、遺傳性耳聾90項(xiàng)基因突變檢測、地中海貧血75項(xiàng)基因突變檢測、地中海貧血全面基因突變篩查、F8基因內(nèi)含子22及內(nèi)含子1倒位突變檢測、龐貝氏病相關(guān)GAA基因突變篩查、脊髓性肌肉萎縮癥基因突變檢測、人類FMR1基因CGG重復(fù)突變篩查、苯丙酮尿癥110項(xiàng)基因突變檢測等。
天昊檢驗(yàn)將利用公司各項(xiàng)創(chuàng)新基因檢測技術(shù)及高素質(zhì)的服務(wù)團(tuán)隊(duì),為促進(jìn)分子診斷水平發(fā)展、提升我國人口健康素質(zhì)做出貢獻(xiàn)!